Un bombardeo durante la Guerra Civil destruyó el conjunto monástico y la nave de la iglesia, que ha permanecido cerrada durante décadas. Ya en el siglo XXI se restauró su cubierta y su fachada. En el año 2012 nace la Asociación de Amigos de la Iglesia de Santiago cuyo fin es concluir su restauración y convertirla en un Centro de Interpretación del Románico.